Ljubljansko višje sodišče je izvedlo javno obravnavo pritožbe tožilstva na sodbo v zadevi z zadevo Stožice. Tožilstvo je v obtožnici navajalo, da so Janković, nekdanji direktor javnega podjetja Ljubljanska parkirišča in tržnice Samo Lozej in nekdanji direktor javnega zavoda Tivoli Ljubljana Roman Jakič z družbo Grep sklenili fiktivno pogodbo, da bodo od stoženskega gradbinca najeli 2500 parkirnih mest, skladišč in drugih površin v zasebnem delu kompleksa Stožice v skupni vrednosti 1,8 milijona evrov na leto. Tožilka Blanka Žgajnar je zatrjevala, da so vpleteni to pogodbo sklenili le zato, da bi pomagati družbi Grep pridobiti izplačilo kredita od konzorcija bank. Vpleteni so ta očitek zavračali s pojasnilom, da je bila navedena pogodba le eden od 27 pogojev za izplačilo kredita.
Drugo kaznivo dejanje, ki ga je tožilstvo očitalo Jankoviću, pa je bila goljufija pri pridobitvi evropskih sredstev. Janković in vodja občinskega oddelka za šport Marko Kolenc naj bi podpisala in takratnemu ministrstvu za šolstvo in šport podala lažne izjave, nekdanja direktorja Grepa Uroš Ogrin in Zlatko Sraka ter vodja projekta gradnje Stožic Andrej Lavrič pa naj bi pri tem pomagali.
Toda tožilstvo ljubljanskega okrožnega sodišča ni prepričalo o utemeljenosti teh očitkov, zato je sodišče soobtožene junija 2023 spoznalo za nedolžne. Tožilki Blanka Žgajnar in Bojana Podgorelec sta se pritožili na sodbo prvostopenjskega sodišča zaradi zmotne ugotovitve dejanskega stanja in bistvenih kršitev določb kazenskega postopka. Zahtevali sta, da višje sodišče razveljavi sodbo okrožnega sodišča in sojenje vrne na prvo stopnjo pred spremenjen sodni senat. Zagovorniki Jankovića in šestih soobtoženih so nasprotno menili, da je prvostopenjska sodba prepričljiva, zato naj višje sodišče pritožbo tožilstva zavrne.
Še en kazenski postopek, povezan s Stožicami
Janković je v še enem kazenskem postopku, ki je povezan s projektom Stožice in ki ga vodi tožilka Žgajnar. V tem postopku Jankoviću obtožnica očita zlorabo položaja ali zaupanja pri gospodarski dejavnosti, ker naj bi nekdanjega direktorja Energetike Ljubljana nagovoril, naj od Grepa kupi prostor, ki pa naj bi ga javno podjetje tako ali tako dobilo v brezplačno uporabo.